辞职后视同缴费年限还算的。

在国有、集体企业工作的员工辞职、被辞退、解除劳动合同等情况下离开原工作单位并且按规定个人不必缴纳社保费的时间视同缴费年限。

自动离职的话可能会存在扣档案，还有就是取消视同年限的危险。因为系统连线的确认需要从档案中找信息，您的档案都被扣下了，肯定会取消你的视同年限。