1984年，南京农学院更名为南京农业大学，农业经济系增设农村金融专业，同年开始招收农村金融和会计审计方向硕士研究生，1985年开始招收金融专业本科生，1998年取得金融学硕士学位授予权，2002年开始招收农村金融专业博士生，2004年取得会计学硕士学位授予权，2010年在应用经济学一级学科下设置金融学博士点。