区别在于：第一、使用方不同：记账联由开票方留存记账用，发票联由购买方使用。

第二、作用不同：记账联是开票方自已留存用来制作会计凭证的原始凭证;发票联要交给购买方用以报销、记账、制作会计凭证的依据。第三、会计科目不同：开票方涉及应收账款、主营业务收入、应缴税金;发票联涉及应付账款、应缴税金、原材料等。

记账联是放到凭证后面做凭证附件用的，发票联是用来抵扣进项税的