南京工程学院排名更好一些。

南京工程学院先后获“江苏省教学工作先进高校”、“江苏省大众创业万众创新示范基地”、“江苏省平安校园示范校”、“江苏省文明校园”、“江苏省2019年度地方普通高校综合考核第一等次”和“江苏省2020年度地方普通高校综合考核第一等次”。因此，该校综合实力要比苏科大好

苏科大排名在南京工程学院之前，前者是本一，后者是本二