MS指理学硕士（master of science），偏研究和基础理论ME指工学硕士（master of engineering），偏技术、实际工程最后给的证书不一样，在美国找工作的话会有影响，一般公司都喜欢有工程背景的，如果你想毕业在美国工作可以选ME，如果想走学者路线就选MS。

其实差别不大。选哪个都很好有出路。