这两个专业都是具有广阔的发展前景和就业市场的热门专业之一，因此哪个专业更好需要根据个人兴趣、能力和职业规划来决定。

下面是对这两个专业的简要介绍：

1. 新能源科学与工程：新能源科学与工程专业主要涉及可再生能源、能源转换与利用等方面的知识与技术，培养学生具备可再生能源工程设计、开发和管理的能力。随着可再生能源的快速发展和对环保能源的需求增加，新能源科学与工程专业具有广阔的就业前景，而且在应对气候变化、实现可持续发展等方面也发挥着关键作用。

2. 自动化：自动化专业主要涉及电子技术、计算机技术、控制理论等方面的知识与技术，培养学生具备自动化系统设计、开发和管理的能力。随着现代化生产和制造技术的快速发展，自动化技术在各个领域中被广泛应用，自动化专业的毕业生具备较高的就业竞争力和薪资待遇。综上所述，选择新能源科学与工程还是自动化取决于你的兴趣和个人目标。你可以考虑自己对可再生能源和环保技术的热情以及对电子技术和计算机技术的兴趣，进一步了解两个专业的课程设置、就业前景和发展方向，以便做出更好的决策。