根据2020年4月学校官网显示，东南大学下设34个院系、83个本科专业。

院系设置

东南大学建筑学院

建筑学、城乡规划、风景园林

机械制造、机械电子、机械设计、工业工程、工业设计、车辆工程

东南大学能源与环境学院

热能与动力工程、建筑环境与设备工程、环境工程、核工程与核技术