毕业证只有专本区别，专业不同，没有好坏之分吧，自考和三本都是国家承认的学历，自考学历可能在某些单位招聘时候会受限制，歧视，不过这是观念问题。

国家单位注重的是学历，企业注重的是能力。两种毕业证都一样，只要你有学历有能力。

有的,自考毕业证一共盖两个章.自学考试就其名字,毕业证上有个自考委的章.还有根据考试专业不同，各个地区都规定了，哪个专业是某某专业的主考院校,然后盖那个学校的章.比如你学北京的国际贸易专业,中国对外贸易大学是主考院校,那样毕业证上就会盖一个自考委的和一个对外贸易大学的章