区别在于等级不同。

一般来说，专业特色是一个学校多年来积累、学科带头人努力、在行业里某方面的学术水平有突出的表现，能够解决行业难题，有独特专长。国家特色，是国家根据发展战略，在行业里挑选出有专业特色的学科加以扶持，力求攻克在国内专业领域的某项难题。

区别是：前者：具有国家的特色，特色明显。后者：专业的特色，专业性强。