同仁堂有南京同仁堂和北京同仁堂。

同仁堂的创始人是乐显扬，虽祖籍是浙江宁波府慈溪县人，但是为北京同仁堂的创始人，顾名思义北京同仁堂是正宗的。北京同仁堂建于清朝康熙8年，也就是1669年，在1723年开始供奉御药，历经八代皇帝188年，在300多年的风雨历程中，历代同仁堂始终恪守炮制虽繁，必不敢省人工，品味虽贵，必不敢减物力的古训，树立了修合无人见，存心有天知的自律意识。

北京同仁堂是国企，清朝同仁堂通过公私合营，最终转变过来的；其他地方的南京同仁堂和台湾同仁堂都是以前同仁堂乐家的分支出去开的店，也取名同仁堂而已，老方子应该是一样的；只不过现在北京同仁堂有国家力量作为后盾，实例是最雄厚的

两者成立的时间不同

1、北京同仁堂是全国中药行业著名的老字号，创建于1669年（清康熙八年），自1723年开始供奉御药，历经八代皇帝188年。

2、同仁堂国际成立于2015年3月，是由金字招牌“北京同仁堂”投资创办的，标志着国有老字号电商在互联网行业做出的转变。

从两者成立时间看一定北京同仁堂是正宗的！

现在的同仁堂是解放初期公私合营的产物。其实应该是老岳家的字号。北京同仁堂应该是同仁堂的下属分公司。