监理工程师各专业证书的含金量排名为：土木建筑工程>交通运输工程>水利工程。

就目前的市场行情来看，建筑工程是需求量最大的，交通运输其次，最后是水利工程。所以土木建筑工程专业的监理工程师证书的含金量也是最高的。

共三个专业，含金量由大到小依次为土建专业、交通运输、水利。