基因重组是指生物进行有性生殖的过程中，控制不同性状的非等位基因的重新组合，只产生新基因型，不产生新基因，为生物变异提供了极其丰富的来源，是生物多样性的重要原因之一。

基因重组包括非同源染色体上非等位基因的重组（自由组合）、同源染色体上非等位基因的重组（交叉互换）、人为导致的基因重组（DNA重组，即基因工程），分别发生在第一次减数分裂后期、第一次减数分裂四分体时期、体外与运载体重组，导入细胞内与细胞内基因重组。非同源染色体上非等位基因的重组：同源染色体分开，等位基因分离，非同源染色体自由组合，导致非同源染色体.上非等位基因间的重组。同源染色体上非等位基因的重组：同源染色体非姐妹染色单体之间交叉互换导致染色单体上的基因重新组合。人为导致的基因重组：目的基因经过运载体导入受体细胞，导致受体细胞中基因重组。

基因重组的本质就是绿色植物身体生殖细胞中DNA序列的改变。

例如插到除此之外的编码序列，二根染色体配对接着裂开和再次联接。重组具备一切正常生理状况的（例如精卵生殖细胞结合后造成细胞的分裂），也是有外部因素使之改变的（例如运用常用工具酶光纤激光切割和插到DNA片段）。