广东医学院东莞校区和湛江校区的区别如下：

1.地理位置不同

2.建设时间不同

湛江这边是老校区，从1958年开始建设，设施较旧，而广东医学院东莞校区是新校区，各方面设施都要好一些，2003年才开始建设的。