河北医科大学基础医学院目前设有人体解剖学、生理学、病理学、生物化学与分子生物学、药理学、病理生理学、组织胚胎学、病原生物学、免疫学、法医学、细胞生物学、医用物理学、医用化学、医用数学、计算机等14个教研室和法医学系。

其中省部共建教育部重点实验室1个。