1、两个专业的性质不同：中西医临床医学是普通高等学校本科专业，属于中西医结合类专业，学科门类属于医学大类，授予医学学士学位，修业年限为五年。

临床医学是普通高等学校本科专业，属于临床医学类专业，授予医学学士学位。

2、两者的本质不同：中西医临床医学其实是最早的中西医结合，是在学习过程中采用中西医两套技能培训，本质上讲还是中医学，临床医学就是西医临床学。