电子工程更好点吧。

两则都是以电子技术为核心，但两都侧重点又有所不同，机械电子工程是侧重机械方面电子应用，主要用在机械控制之类方面，电子工程是侧重通信、技术方面东西，学理论东西更多，应用更为广泛，不过因为应用广泛，学它就更多，竞争也就更激烈一些。

机械电子工程和电子工程不能说哪个好。前者是机械电子都要懂，是搞机电一体化的，掌握的知识面要比电子工程掌握知识面更宽。