区别如下：性质不同：专硕是属于硕士学位的一种类型；在职研究生是硕士学位的一种报考方法。

培养方式不同：专硕重在培育具有厚实理论基础，并适应特定行业或职业的应用型高层次专门人才；在职研究生是在职人员一边工作，一边学习的类型。报名条件不同：专硕对报名人员的要求较高，对工作经历有严格要求，绝大多数专硕还要求在职人员报考需经过所在单位或相应管理部门的同意，有的要求所在单位推荐；在职研究生大专及以上学历都能报名，有的对工作经历没有要求。入学方式不同：专硕不管是选择全日制，还是非全日制，都是先考试后入学；在职研究生可以参与入学考试，也可以不参与入学考试。