有昌吉州第一中学，昌吉州第二中学，昌吉州第四中学，昌吉市第一中学，昌吉市第四中学，昌吉市第九中学，行知学校，玛纳斯县第一中学，呼图壁县第一中学，阜康市第一中学，吉木萨尔县第一中学，奇台县第一中学，奇台县第二中学，木垒县第一中学，共14所高中学校。

州一中，州二中，市一中，市四中，九中，昌吉有五所高中