归档文件整理是指将归档文件以件为单位进行组件、分类、排列、编号、编目等（纸质归档文件还包括修整、装订、编页、装盒、排架；电子文件还包括格式转换、元数据收集、归档数据包组织、存储等），使之有序化的过程。

在这个过程中，组件、分类、排列、编号、编目是纸质归档文件与电子文件整理的通用整理流程，亦即归档文件整理的一般要求。此外，纸质归档文件还包括修整、装订、编页、装盒、排架等整理流程，电子文件还包括格式转换、元数据收集、归档数据包组织、存储等整理流程。整理原则I、归档文件整理应遵循文件的形成规律，保持文件之间的有机联系。

2、归档文件整理应区分不同价值，便于保管和利用。

3、归档文件整理应符合文档一体化管理要求，便于计算机管理或计算机辅助管理。

4、归档文件整理应保证纸质文件材料和电子文件整理协调统一。

做好档案整理的五个流程及其原则是：档案的分类，排列，编号，编目，装订（装盒）。就是将同一类别或者是同一问题的档案分类，按序排列，编号，编写目录，进行装订或者是装盒。档案是历史的真实记录，整理档案要遵循档案形成的自然规律，保持档案之间的历史联系，更好的为提供利用服务。