是一个多部过程，需要不同的targetting sequences,定位到叶绿体的前体蛋白N端具有40-50个氨基酸的transit peptide,用以指引多肽定位到叶绿体并进一步穿过叶绿体被膜进入基质中。

另外，这些细胞器蛋白最终定位还需要其他空间定位序列参与决定。以上属于共翻译转运途径。此外，通过翻译后转运途径进入叶绿体也必须在分子伴侣的帮助下解折叠或维持非折叠状态，这有利于通过膜上的输入装置。叶绿体蛋白质跨膜运转的特点活性蛋白水解酶位于叶绿体基质内叶绿体膜能特异地与叶绿体蛋白的前体结合叶绿体蛋白质前体内可降解序列因植物和蛋白质种类不同而表现出明显差异