个人缴纳的住房公积金可以从个人应税收入中扣除，即，这部分不计入纳税基数。

《中华人民共和国个人所得税法》第二十五条按照国家规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。