医学部非常好京都大学在医学教育与研究方面，除学科齐全的医学部和药学部外，还有设备先进、功能多样的附属医院。

京都大学医学部含有基础和临床两大分部的若干系科共有39个讲座，附属机构有校医院，脑神经研究、免疫学研究设施。