牡丹江大学和牡丹江医学院区别一是：牡丹江医学院是属于本科院校，毕业生是有学士以上学位，牡丹江大学是属于高职高专，毕业生没有学位。

二是：牡丹江医学院是医学专业学院，牡丹江大学是属于综合专业高职学校。三是：牡丹江医学院是省财政拨款 牡丹江大学是牡丹江市财政拨款。