1、南通理工学院和杏林学院，都属于民办本科，但是南通杏林学院略强于南通理工学院。

2、杏林学院有南通大学作为背书，社会认可度更高一些；南通理工学院是由紫琅学院这所专科院校升级而来，而紫琅学院曾经在当地的口碑很是一般。

3、从近几年的录取分数线来看，杏林学院也是高于南通理工学院。