已经入账的款需要退回，应该履行以下流程:1.经办人提出申请，书面申请中需要详细说明退款的理由和金额。

2.会计审核，审核是否确实已入账。

3. 按照内控权限审批。

4. 出纳付款。其中需要重点注意的写好是，必须原路退回，即退回原来的打款账户。这是为了避免出借账户或洗钱的嫌疑。