消防工程施工备案的流程如下：

网上申报

承包人首先需要登录政府门户网站，在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报。

根据合同的具体性质和内容，在对应的合同备案表中填写相关信息，并打印出带条型码的合同备案表。

办理备案手续

合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。所需资料可能包括：

《建设工程施工合同备案表》

全部《建设工程施工合同》原件和副本

招标文件、招标控制价及电子数据

中标人的商务标和中标价及电子数据

工程预算书

担保保函（如实行担保）

法定代表人授权委托书等。

正式签发合同备案表

备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章，并正式出具《合同备案表》。

需要注意的是，根据最新的法律法规，施工合同备案登记制度已经全面取消，现在只需要携带施工合同申请办理工程质量安全监督手续和施工许可证即可。因此，建议在实际办理过程中，先咨询当地建设行政主管部门，了解最新的政策和流程。