监理工程师的专业选择主要包括：

1. 土木建筑工程

涉及建筑工程、道路与桥梁工程、市政工程等领域。

由住房和城乡建设部负责。

2. 水利工程

包括水务工程、水利水电工程、水文与水资源工程、港口航道与海岸工程。

由水利部负责。

3. 交通运输工程

包括道路桥梁与渡河工程、城市地下空间工程、给排水科学与工程、建筑电气与智能化。

由交通运输部负责。

考生在报名时可以根据自己的实际工作需求和所在地区的市场需求来选择合适的专业。需要注意的是，考生在取得一个专业的监理工程师资格证书后，第二年可以增报其余专业，但每次只能增报一个专业。