注册监理工程师课程设置包括以下四个科目：

《建设工程监理基本理论和相关法规》

《建设工程合同管理》

《建设工程目标控制》

《建设工程监理案例分析》

其中，《建设工程监理基本理论和相关法规》和《建设工程合同管理》为基础科目，《建设工程目标控制》和《建设工程监理案例分析》为专业科目。考生在报名时需要选择一个专业类别进行考试。