公路水运监理工程师的考试科目包括以下几部分：

基础科目

《建设工程监理基本理论和相关法规》

《建设工程合同管理》

专业科目

《建设工程目标控制》（分为土木建筑工程、交通运输工程、水利工程3个专业类别）

《建设工程监理案例分析》（分为土木建筑工程、交通运输工程、水利工程专业）

建议考生在报名时根据实际工作需要选择专业科目，以便更精准地准备考试。