专业监理工程师是 工程监理层的重要成员，他们负责具体的专业监理工作，并在一定程度上指导监理员的工作。专业监理工程师在项目监理机构中属于中间管理层，位于总监理工程师之下，负责实施某一专业或某一岗位的监理工作，如土建、安装、装饰等。他们具有相应的监理文件签发权，可以对施工过程中的质量问题、进度问题等进行监督和指导。

此外，根据《关于部分专业技术类职业资格与职称对应认定有关问题的通知》（黑人社规〔2018〕12号），监理工程师为准入类职业资格类别，对应职称层级为高级工程师（副高级）。

综上所述，专业监理工程师在项目监理机构中属于 中间控制层或 执行层，负责具体的专业监理工作，并在一定程度上指导监理员的工作，确保工程的质量、安全和环境保护。