没有区别。

1、民办二本和公办二本毕业证是一样的，都是国家承认的普通高校全日制本科毕业证。

2、公办二本高校与民办二本高校都是经教育部主管部门批准设立的，只要是高考中统一报志愿，统一组织录取的毕业证都是一样的，公办院校办学经费来源于政府部门，而民办院校办学经费完全靠自筹。

公办二本的经费来源于财政支持，民办二本则是由投资者自筹资金办学。从这个层面上说，公办二本带有公益性质，其收费标准较低；民办高校是投资行为，追求投资收益也是一个主要目的，收费普遍较贵。