监理工程师主要负责监督和管理工程建设过程中的各项手续和程序，具体包括以下内容：

施工许可证：

确保施工单位已经获得了相关的建设许可证和施工许可证。

施工图审批：

审核施工图纸，确保施工图纸符合设计要求和规范。

质量验收：

对建设过程中的质量进行监督和检查，确保工程质量符合相关标准和规范。

安全验收：

对建设现场的安全进行监督和检查，确保施工过程中的安全措施得到落实。

竣工验收：

对工程竣工后进行验收，确保工程符合设计要求和相关标准。

环保手续：

确保建设过程中的环保手续得到落实，包括环境影响评价、排污许可证等。

其他手续：

对其他与工程建设相关的手续进行监督和管理，包括土地使用手续、水电气等配套设施的手续等。

此外，监理工程师在工程监理过程中还需要负责以下事项：

签署和审核监理文件，如监理报告、检测报告、变更通知书等，这些文件需要由其签字盖章后方可生效。

向业主和建设单位提供专业咨询服务，以确保项目顺利实施，并符合相关法律法规和标准。

在支付工程进度款时，严格进行工程质量审核，只有现场监理签证合格或已经过验收的单元、分部工程才能办理支付签证手续。

综上所述，监理工程师在工程建设过程中扮演着至关重要的角色，其职责涵盖了从施工前的各项手续审核到施工过程中的质量、安全和环保监督，再到施工完成后的验收等各个环节。