包括极端微生物和环境工程、生物分离、生物信息与生物催化工程、工业生物催化、分子定向进化、抗体与生物催化工程、药物控缓释、蛋白质折叠、生物修复及仪器分析等十多个实验室，从事生物催化技术、蛋白质工程、生物分离工程、生物医药工程、环境生物工程及细胞培养工程

清华大学工业系有应用化学，放射化学，材料化学，食品化学，环境化学。(专门方向，无机化学，有机化学，分析化学，物理化学，生物化学，高分子化学)。