blastn 是用DNA序列去检索其匹配序列时的选项，告诉程序你的序列是核酸序列，你希望检索核酸库，是最常用的一种检索方式。

balstp是用蛋白序列去检索时的选项。blastx是你希望数据库把你提交的序列去同时检索DNA库和蛋白库。tblastn是你提交的是DNA序列，你希望程序自动将其翻译后去检索相匹配的蛋白序列。所以，选择什么检索方式是根据你提交的序列种类和你希望检索出来的序列种类来决定的。