1、信托基金的投资结构相比其他基金比较复杂，基金只是基金的投资人和基金的管理人形成基金的结构，在信托基金中还有的受托管理人和质押担保人。；

2、信托基金的灵活性较差，主要是因为信托基金的税务结构复杂，中国对于信托基金的税务安排比较繁琐。

信托基金的风险

1、在证券市场出现强烈的波动时，投资人来不及对基金进行平仓的时候，那么委托人的资金就有可能出现亏损的风险；

2、在中国的利率出现变化的时候，会导致长时间的信托基金出现风险，信托基金的贷款利率会和中央银行的利率一起调整，这就是利率风险发生的主要原因；

3、信用风险，即投资人能否收回投入在基金的本金和收益的风险；

4、流动性风险，信托基金和一般基金一致都具有流动性风险，但是信托基金的没有一个成熟的转让市场所以流动性风险小很多。