长江的入海口在上海市崇明岛。

长江口水域是上海市重要水源地，同时兼具工农业取水、通航、纳污、围垦、生态等多种功能。长江口已成为上海市建设世界级城市的重要支撑之一。其水资源的开发、利用和保护已成为人们关注的焦点。长江口不仅是多种生物周年性溯河和降河洄游的必经通道，也是亚太候鸟迁徙的主要驿站。