锦鲤是由日本人精心培育的品种，所以在品种血统上都有比较系统的分类，而花鲤，可能只是因杂交变异而产生的带有花斑的普通鲤鱼。

二者在观赏价值上有很大的差别，长尾的锦鲤称为龙风鲤，有金色的。锦鲤性别普通饲养者是很难区分的，即使是养殖场的人也很难说准哪条鱼一定是雌或雄。一般到性成熟期追尾的鱼可以基本断定是雄的。雌鱼肚子比较大,因为都是未产的卵。