一般野生的水芹菜会有寄生虫；而采用无土种植，直接使用营养液的一般都不含有寄生虫，而且也会比较嫩。

含有寄生虫的水芹菜需要经过充分的洗净、盐洗、焯水等多种杀菌去虫清洗，方可食用。水芹菜一般指水芹。水芹是伞形科，属多年生草本植物，茎直立或基部匍匐。基生叶有柄，基部有叶鞘；叶片轮廓三角形。复伞形花序顶生；无总苞；伞辐不等长，直立和展开；萼齿线状披针形，花瓣白色，倒卵形，有一长而内折的小舌片；花柱基圆锥形，直立或两侧分开。果实近于四角状椭圆形或筒状长圆形，侧棱较背棱和中棱隆起，木栓质。花期6-7月，果期8-9月。