在马蹄莲开始休眠时，减少浇水，叶子自然枯死后，等盆土全干后，把种球从盆里挖出来。

也可以把球根用抗菌药水泡一下，再晾干，用纸包起来，放进纸箱，在放进冰箱冷藏，温度在5到7摄氏度之间。注意:在储存球根时，不要做过多的处理，要保持储存温度造5到7摄氏度之间，否则极易造成球根老化，影响生长。一般的马蹄莲球根也只能连续中3到4年，球根老化就会导致无法继续生长。