西瓜玉髓的透明度比碧玺要差，碧玺透明度比较高。

西瓜玉髓作为隐晶质体，看上去相较于碧玺来说模糊，而碧玺是单晶体，清晰度较高。将西瓜玉髓和碧玺放在偏光镜下看，转动宝石时碧玺有明暗变化而玉髓是全亮的。