单倍型，是单倍体基因组的简称，在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合；通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。

按照某一指定基因座上基因重组发生的数量，单倍型甚至可以指至少两个基因座或整个染色体。