拮抗作用是指两种物质对一个生理过程的调节是反向的，完全相反的作用。

一个安定的、处于生物平衡的正常微生物群，对包括人体致病菌在内的外籍菌有明显的生物拮抗作用。导致生物拮抗的原因，是微生物及其产生的多种分泌物质的作用，其中厌氧菌起着重大作用。