启迪与启迪清源的区别在于业务方向和公司规模。

启迪在核电技术、燃料循环和辐射应用等领域进行研发和应用探索；而启迪清源则主要致力于研发和生产放射性同位素、核医学和辐射应用等领域的核技术产品和服务。此外，启迪作为国内首家商业化运营的核电基地，管理的核电站数量和规模都比启迪清源大。