超音速飞行时机舱里缺氧是因为在超音速飞行过程中，当飞机加速到超音速时，会产生巨大的气动力，导致周围空气被压缩并迅速流过飞机表面。

这种高速流动的空气会引起剧烈的气流压力变化，特别是在飞机机头和机身之间的冲击波区域，形成所谓的超音速冲击波。超音速冲击波会引起激波，激波后方的气流密度会明显减小，压力也会下降。在超音速飞行时，机舱内部的气压无法即时调整以适应外界的气流压力变化，导致机舱内气压降低，出现缺氧现象。