自建房两层顶上的楼梯间不算一层。

一层通常指建筑物中的实际层面，包括居住空间、起居区、卧室等。楼梯间只是用于连接楼层的通道，不被单独计算为层。建议在进行自建房规划或与当地建筑相关机构咨询时，对于楼层计算和规定可以获得准确的信息和指导。这样可以确保您的自建房设计和规划符合当地的建筑法规和标准。