二南开指标生分普通班，第二南开中学班型设置为公能班、重点班及普通班。

公能班源于南开系列学校的校训。公能班、特长班在学生活动、思维训练、能力培养、高考成绩等方面均有很大的优势。公能班自成立以来历届高考一本上线率均达到100%。