光学工程师证书的报考流程是：找到机构或单位，提交报名资料（身份证正反面照片、个人近期免冠照片等），审核通过后，进行缴费，缴费成功后，完成报名。

需要注意的是，光学工程师证书的报考条件是：本科毕业，获得学士学位后，从事本专业工作四年以上；专科毕业，从事本专业工作四年以上等。