底薪3500综合薪资5000是指员工每月的工资收入为5000元，这5000元是员工实际得到的总工资。

综合薪资一般是根据员工的底薪、奖金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等来计算的。底薪3500元加上其他的福利和补贴等，最终得到的综合薪资为5000元。