发的豆芽会发黑的原因是因为豆芽暴露在阳光下或者长时间浸泡在水中或者长时间没有对豆芽进行清洗，这会导致绿豆芽内部结构遭到破坏因而腐烂从而发黑。

此时的发黑豆芽是不能够再食用的，不然会对人体有害。所以，要想发的豆芽不发黑应当用通风透气的布块盖住，另外，用20度的水淋豆芽，隔几个小时用水冲洗一遍。