荸荠的表皮极易带菌，烹制前必须洗净、去皮、用开水烫一下。

荸荠不宜生吃，因为荸荠生长在泥中，外皮、内部都有可能附着着较多的细菌、寄生虫，所以一定要洗净煮透后方可食用，而且煮熟的荸荠更甜。熟荸荠多用于做配料，也可用于炒、烧、做馅心。荸荠可消宿食，饭后食用。荸荠用水煎服，能利尿排淋，对尿道感染患者有辅助治疗作用。